מה אם המלחמה הזו הייתה מסתיימת מחר? לא שווה להילחם בשביל זה? לא שווה למות בשביל זה? תומאס "נאו" אנדרסון החליט החלטה גורלית כשהוא בחר לשאול את השאלה אותה מורפיאוס וטריניטי שאלו אותו קודם. לחפש ולקבל את האמת. לשחרר את מוחו מהמטריקס. הכל מתחיל בבחירה. בפרק השני בטרילוגיית המטריקס, נאו לומד לשלוט בכוחותיו הבלתי רגילים בזמן שציון נמצאת תחת מצור של צבא מכונות.
